當數控深孔機床在工作的過程中，有很多情況是始料未及的，因此事先是很難對其結構剛度進行準確計算的。在此情況下，也就是只能計算部分構件的剛度，而對于像床身、立柱、工作臺和箱體等重要零件的彎曲和扭轉變形，接合面的接觸變形等，只能將其簡化后進行近似計算，但計算結果往往與實際相差甚大。

為了減少誤差，也嘗試了采用有限元法進行分析計算，并結合模型、實物或類似的樣機進行試驗、分析和對比，才能確定合理的結構方案。首先一定要正確選擇構件截面的形狀和尺寸；同時正確布置隔板和筋條，以便于提高構件的靜、動剛度。
對于數控深孔機床來說，導軌和支承件的聯接部件往往是局部剛度最弱的部分，但聯接方式對局部剛度的影響也很大。也就是說，只要選用適當的聯接方式，就能有助于構件局部剛度的提高。